1. Lãnh đạo Sở, gồm: Giám đốc và không quá 03 Phó Giám đốc.
2. Các phòng và tương đương thuộc Sở gồm:
- Văn phòng Sở, cơ cấu tổ chức gồm: Chánh Văn phòng; Phó Chánh Văn phòng; công chức chuyên môn, nghiệp vụ; nhân viên.
- Thanh tra Sở, cơ cấu tổ chức gồm: Chánh Thanh tra; Phó Chánh Thanh tra; công chức chuyên môn, nghiệp vụ.
- Phòng Khoáng sản, cơ cấu tổ chức gồm: Trưởng phòng; Phó Trưởng phòng; công chức chuyên môn, nghiệp vụ.
- Phòng Đo đạc, Bản đồ và Viễn thám, cơ cấu tổ chức gồm: Trưởng phòng;
Phó Trưởng phòng; công chức chuyên môn, nghiệp vụ.
- Phòng Môi trường, Nước, Khí tượng thủy văn và Biến đổi khí hậu, cơ cấu tổ chức gồm: Trưởng phòng; Phó Trưởng phòng; công chức chuyên môn, nghiệp vụ.
- Phòng Quản lý đất đai, cơ cấu tổ chức gồm: Trưởng phòng; Phó Trưởng phòng; công chức chuyên môn, nghiệp vụ.
3. Các đơn vị sự nghiệp công lập trực thuộc Sở:
- Văn phòng Đăng ký đất đai.
- Trung tâm Quan trắc Tài nguyên và Môi trường.
- Trung tâm Kỹ thuật Tài nguyên và Môi trường.